位於屏東縣屏東市，於2022年01月奉行政院核定推動，並於2023年05月辦理公共工程動土並提供廠商同步建廠。總面積73.51公頃，南側緊鄰臺1線串接高雄市及屏東市，西側臨近推動中之國道7號，往北可銜接國道10號，往南可達高雄機場及高雄港。
未來園區北側設有高鐵屏東站與臺鐵六塊厝新站，車程5分鐘內可抵達，另鄰近屏東運動園區、屏東健康產業園區、屏東榮民總醫院及屏東市區，周邊住商休閒生活機能充足。距離左營高鐵站約40分鐘、高雄港約45分鐘、高雄機場約40分鐘。
依據「科學園區設置管理條例」第3條「園區之設置與管理，依本條例之規定。但其他法律之規定，對促進高級技術之產業發展較本條例更有利者，適用最有利之規定。」。因此，進駐科學園區之事業，除可享有法律明定之科學園區專屬優惠措施外，亦得同時適用園區外其他更具優惠性之相關法令。綜合上述，科學園區具備以下整體投資優勢：
一、投資競爭力
(一)單一窗口行政服務
１、投資服務(招商服務、形象塑造、入區申請審核、僑外投資)
２、工商服務(工商登記、海關駐區服務、通關自動化、增減資)
３、環安服務(消防隊、保警隊、勞工權益、工安環保、污水處理廠)
４、營建服務(基礎工程建設、水電交通、設施維護)
５、建管服務(園區整體規劃、土地廠房宿舍出租管理)
(二)租稅優惠
園區屬保稅區，園區事業自國外輸入自用之機器、設備、原料、物料、燃料、半製品、樣品及供貿易用之成品，免徵進口稅捐、貨物稅及營業稅，僅須依關稅法相關規定辦理通關手續，無須另行申辦免稅核准、擔保、記帳或繳納保證金。另園區事業從事產品或勞務外銷者，其營業稅適用零稅率，並免徵貨物稅，有效降低企業進出口與營運成本，提升整體投資效益與國際競爭力。
(三)充沛的研發資源
科學園區的核心競爭力，源自於創新技術研發能量與高階產業人才的持續匯聚。南部科學園區透過推動「南部科學園區新興科技應用計畫」，有效整合產學研資源，加速關鍵技術落地與創新產品開發，協助園區廠商提升技術門檻與市場競爭優勢；同時藉由「科學園區人才培育補助計畫」及「園區人才培訓暨產學合作計畫」，建立學生實習、企業用才與在職進階培訓之完整銜接機制，並建置完善的人才媒合平臺，穩定供應園區所需專業人力，降低企業招募與培訓成本，強化企業快速擴產與營運成長所需之人力支撐，整體形塑具高度投資吸引力與長期發展潛力的產業聚落。
二、產業規劃
屏東園區規劃引進智慧農醫、綠色材料、太空科技及其他新興科技等四大主軸產業，引領在地產業轉型升級與創新，並加速科技產業落地成形。與嘉義園區、臺南園區、高雄園區、橋頭園區及楠梓園區串聯成為南臺灣科技產業廊帶，與高雄、屏東周邊產業園區之在地產業相輔相成，形塑產業群聚效應。
(一)智慧農醫產業：以生物科技朝植物用藥、動物疫苗及醫材發展，鏈結屏科農學院、工學院以及屏東種苗研究中心等學研資源，目前已引進聚和等公司投資設廠。
(二)綠色材料產業：結合縣內綠能光電產業，加上半導體再生材料及電動車上游材料相關供應鏈，朝節能、儲能、創能及輕量結構化材料方向發展，目前已引進宇晨等公司投資設廠。
(三)太空科技產業：結合南臺灣既有通訊、金屬加工等產業量能，鏈結縣內「短期科研探空火箭發射場域」，朝地面接收設備、衛星及火箭之零組件、酬載與系統等發展，提升縣內基礎加工產業。
(四)其他新興科技產業：以既有科學園區之六大產業為基礎，引進淨零科技、智慧機械及低碳移動等產業，以保留園區發展其他對社會經濟發展與重大影響之科技產業的可能性。
依據「科學園區設置管理條例」第3條「園區之設置與管理，依本條例之規定。但其他法律之規定，對促進高級技術之產業發展較本條例更有利者，適用最有利之規定。」，因此，進駐科學園區之事業，除可享有法律明定之科學園區專屬優惠措施外，亦得同時適用園區外其他更具優惠性之相關法令。綜合上述，科學園區具備以下整體投資優勢：
一、投資競爭力
(一)單一窗口行政服務
１、投資服務(招商服務、形象塑造、入區申請審核、僑外投資)
２、工商服務(工商登記、海關駐區服務、通關自動化、增減資)
３、環安服務(消防隊、保警隊、勞工權益、工安環保、污水處理廠)
４、營建服務(基礎工程建設、水電交通、設施維護)
５、建管服務(園區整體規劃、土地廠房宿舍出租管理)
(二)租稅優惠
園區屬保稅區，園區事業自國外輸入自用之機器、設備、原料、物料、燃料、半製品、樣品及供貿易用之成品，免徵進口稅捐、貨物稅及營業稅，僅須依關稅法相關規定辦理通關手續，無須另行申辦免稅核准、擔保、記帳或繳納保證金。另園區事業從事產品或勞務外銷者，其營業稅適用零稅率，並免徵貨物稅，有效降低企業進出口與營運成本，提升整體投資效益與國際競爭力。
(三)充沛的研發資源
科學園區的核心競爭力，源自於創新技術研發能量與高階產業人才的持續匯聚。南部科學園區透過推動「南部科學園區新興科技應用計畫」，有效整合產學研資源，加速關鍵技術落地與創新產品開發，協助園區廠商提升技術門檻與市場競爭優勢；同時藉由「科學園區人才培育補助計畫」及「園區人才培訓暨產學合作計畫」，建立學生實習、企業用才與在職進階培訓之完整銜接機制，並建置完善的人才媒合平臺，穩定供應園區所需專業人力，降低企業招募與培訓成本，強化企業快速擴產與營運成長所需之人力支撐，整體形塑具高度投資吸引力與長期發展潛力的產業聚落。
二、產業規劃
嘉義園區規劃引進精準健康、智慧載具、智慧農業及其他新興科技等四大主軸產業，以研發創新為核心，帶動嘉義地區產業升級與轉型。園區並將與臺南園區、高雄園區、橋頭園區及屏東園區串聯，形塑南臺灣科技產業廊帶，促進區域產業分工與合作，協助在地產業進行軟硬體加值，並與嘉義縣市既有產業園區進行跨域整合，逐步建構具聚落效應之產業發展體系。
(一)精準健康產業：鏈結嘉義縣市長庚醫院、嘉義基督教醫院、嘉義聖馬爾定醫院及大林慈濟醫院等醫療量能，發展穿戴式健康監測裝置、醫用影像與生物辨識技術、遠距醫療與智慧照護系統，以及智慧輔具等應用，推動精準預防、診斷與照護服務。目前已引進新鈺、信天翁等公司投資設廠，逐步形塑精準健康產業聚落。
(二)智慧農業：結合中正大學、嘉義大學及相關產業公協會之研發與技術能量，規劃引進智慧農機、農場管理系統（涵蓋生產履歷、智慧監控及通訊技術）及農業生技等相關廠商，促進農業數位化、智慧化與高值化發展。
(三)智慧載具產業：串聯大埔美精密機械園區、馬稠後產業園區及中科院民雄航太園區之產業基礎，聚焦引進電動車、自駕車及無人機等智慧載具相關供應鏈廠商，發展關鍵零組件、系統整合與應用技術。目前已引進經緯航太、凌威航太及芊達等公司投資設廠，強化區域智慧載具產業能量。
(四)其他新興科技產業：以既有科學園區六大產業為發展基礎，彈性引進淨零科技、智慧機械、低碳移動等新興產業，保留園區未來發展具高度社會與經濟影響力科技產業之空間與可能性，提升園區整體發展韌性。
