臺南園區南側聯外道路命名及通車典禮、經濟部中小企業處南科育成中心啟用。
2003年11月80日
南科緊急應變聯防組織成立並舉行授旗成軍。
行政院院長游錫堃視察路竹園區並宣佈電信技術中心設置於路竹園區。
內政部核發變更許可，變更台南科學工業園區路竹基地開發計畫及細部計畫-第一次暨第二次變更
2003年09月25日
管理局局長戴謙與成大育成中心赴美國舊金山、洛杉磯、芝加哥及休士頓舉辦招商說明會及拜會廠商（至10月6日）。
2003年09月01日
南科國中及南科國小雙語班設立及招生。
行政院院長游錫堃南下視察蒞臨本局視察園區開發營運現況。
管理局局長戴謙及副局長吳盟分會同經濟部赴歐洲（法國、荷蘭、希臘）及以色列招商（至07月12日）。
2003年06月02日
南部科學工業園區管理局新團隊佈達暨誓師大會。
路竹組正式成立暨進駐路竹園區。
2003年05月01日
臺南園區資源再生中心正式營運。
科學城物流股份有限公司獲准於臺南園區設立物流中心。
國立成功大學創新研發中心核准進駐。
國立中正大學創新研發中心核准進駐。
